Atualmente existem várias soluções para controlar a rotação de uma fan, pelo pwm da placa mãe, controladores de fan que possuem até controle remoto.
Navegando pela internet encontrei uma opção mais “raiz” de fazer esse controle alternando os fios de alimentação da fan, como eu gostei bastante da teoria de conseguir outras tensões da fonte alternando os cabos de um conector molex resolvi compartilhar aqui no blog por que além de programação eu gosto bastante de eletrônica também, apesar de conhecer muito pouco.
A seguir vou inserir a imagem de exemplo onde a alimentação é de um cabo molex e uma fan de 12v, se for testar recomendo antes utilizar um multímetro para confirmar as tensões e só depois conectar uma fan que utilize a alimentação de 12v, se for uma fan que consuma menos você pode queimá-la, por isso tome muito cuidado.
Fonte:
https://www.hardware.com.br/comunidade/diminuir-cooler/1113524/