Se você utiliza o cPanel/WHM e também utiliza o CloudFlare provavelmente você já se deparou com alguns desses avisos:
AutoSSL reduced SSL coverage
DNS DCV error (domain.com.br): The DNS query to “_cpanel-dcv-test-record.domain.com.br” for the DCV challenge returned no “TXT” record that matches the value “_cpanel-dcv-test-record=xxx...”.
HTTP DCV error (domain.com.br): The system queried for a temporary file at “http://domain.com.br/.well-known/pki-validation/xxx....txt”, but the web server responded with the following error: 404 (Not Found). A DNS (Domain Name System) or web server misconfiguration may exist. The domain “domain.com.br” resolved to an IP address “111.222.333.444” that does not exist on this server.
Para resolver esse problema você pode alterar o DNS para o servidor diretamente sem utilizar o CloudFlare e após a propagação do DNS atualizar o certificado.
Caso queria continuar utilizar o CloudFlare a cada 3 meses mais ou menos você terá que acessar o painel do CloudFlare, selecionar o domínio desejado, clicar em Visão Geral (Overview), procurar por Pausar o Cloudflare no site ( Pause Cloudflare on Site) e clicar em confirmar.
Espere alguns minutos, por volta de 15 minutos e vá até o WHM em Gerenciar AutoSSL, clique em Gerenciar usuários e procure pelo usuário que apresentou o problema e clique em Verificar “usuário” e aguarde alguns minutos.
Clique na aba Logs e caso não aparece o log do usuário clique no botão Atualizar e depois Exibir Log, verifique se no final do log aparece a mensagem:
“ÊXITO O certificado está instalado!”
Essa mensagem pode levar alguns minutos para aparecer, depois que estiver tudo certo você pode habilitar o CloudFlare novamente, espero ter ajudado!