Para alterar a extensão de vários arquivos de uma única vez você pode utilizar a seguinte dica.
Crie um arquivo com um editor de texto simples, recomendo o bloco de notas, e escreva o seguinte:
ren *.JPG *.jpg
Salve o arquivo como por exemplo: renomear.bat, depois de salva-lo clique duas vezes em cima dele para executa-lo e pronto.